Busenlabs Linux

2017/05/23

Jupyter でRをつかう

環境:    Ubuntu 16.04.2 LTS

JupyterでRをつかいたいのですが、パッケージをいれようとして、エラー発生。
そのときのメモ。
Jupyterは anacondaでいれる。ほかの選択肢は考慮しなかった。

Rのインストールは
$ conda install -c r r-essentials
$ conda install -c defaults zeromq
としておいた。
ここまででJupyterでRは動作する。
問題はここから。

Analysis of Dose-Response Curves パッケージ "DRC"をいれようとしてこける。

Rのプロンプトにて

> install.packages("drc", dependencies = TRUE)

sh: 1: make: not found

make がない? 
build-essentialをいれていなかった。

$ sudo apt-get install build-essential

gtoolsの取得でエラーしておる。
> install.packages("gtools", dependencies = TRUE)

make: gfortran: Command not found
/usr/bin/ld: cannot find -lgfortran 

とでてる。。

fortran のパッケージが不足してるようです。

$ sudo apt-get install gfortran

再度インストール。次は、、、

libSM.so.6: cannot open shared object file: No such file or directory

qtのライブラリがたりん

$ sudo apt-get install -y python-qt4

> install.packages("gtools", dependencies = TRUE)

この状態でgtoolsの取得がうまくいった。


> install.packages("drc", dependencies = TRUE)
この状態でdrcの取得がうまくいった。

jupyter


うまくいったようだ

作成日: 2017/05/23 17:53


ilovelinux at 20:56│Comments(0)Ubuntu 

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